Conan Edogawa es el protagonista de la serie. En realidad es Shinichi Kudo, el famoso detective juvenil, pero la Organización de los Hombres de Negro le dio un veneno denominado APTX 4869, que provocó que el cuerpo del detective rejuveneciera hasta adoptar el aspecto de un niño de primaria. Utilizando el nombre falso de Conan, tiene como objetivo encontrar a esos hombres para que le devuelvan su verdadera forma mientras resuelve los casos que se le presentan a través de Kogoro Mouri.

Conan intenta comportarse como un niño pequeño, aunque muchas veces mete la pata diciendo frases complejas o cosas demasiado inteligentes para su edad.

Actualmente, los adultos se han acostumbrado a ello, y solo lo reconocen como un niño muy inteligente.

Respecto a sus gustos, no trata de ocultar que le encanta Sherlock Holmes y el fútbol, a menudo, en sus casos si encuentra algún balón se pone a darle golpes ya que le ayuda a pensar mejor.

Conan es muy cariñoso y amable con la gente que le rodea como hacía Shinichi Kudo, como a Ran Mouri, sin embargo ella no se da cuenta de su verdadera identidad aunque muchas veces lo sospechó.

Cuando, debido a que su apariencia de niño oculta su identidad como Shinichi Kudo, alguien que le conoce por su forma adolescente dice algo ofensivo o insultante sobre él, sin darse cuenta de que realmente lo dice en presencia del propio Shinichi, muchas veces guarda mentalmente para sí frases que denotan su preferencia por adoptar una actitud despectiva hacia quién dice esos comentarios, o en el mejor de los casos sencillamente burlarse de ellos. Además, debido a que su elevado poder de deducción le permite comprender fácilmente situaciones que para otras personas pueden resultar incomprensibles dado lo complejas que son, tiene la costumbre de jactarse mentalmente, de un modo bastante intelectual, y por lo general siendo bastante sarcástico y presumido, sobre la enorme ventaja que les lleva a quienes, tratando de comprender dicha situación, están "a años luz" de hacerlo al punto que lo ha hecho él. Por ejemplo cuando, durante la resolución de un caso en que Kogoro Mouri se ve involucrado, este da grandes muestras sobre lo equivocado que está respecto a la dirección en que se está resolviendo, momento en el que Shinichi mentalmente suele descartar con una actitud burlona que haya sido del modo que él sostiene o apoya como ocurrió todo.

Debido a que no está familiarizado con los juegos populares y programas de televisión, Genta y los otros tienden a pensar en él como si fuera un tonto. Esto molesta a Conan tanto que secretamente ve la televisión en la sala después de que Kogoro y Ran se vayan a dormir para conseguir más "práctica".

Conan tiene el pelo castaño oscuro que en su mayoría se cuelga hacia abajo, justo por encima de sus ojos azules, pero también hay algunos filamentos que sobresalen en la parte delantera y trasera de la cabeza. El atuendo habitual de Conan se compone de una chaqueta de traje azul con un solo botón y un par de pantalones cortos, a pesar de que ha llegado a usar ropa más informal, con el paso del tiempo. También lleva una pajarita roja y anteojos viejos de su padre. Ambos artículos fueron posteriormente modificados específicamente por el profesor Agasa para incluir un cambiador de voz , micrófono y dispositivo de rastreo, (respectivamente) para ayudar a Conan en sus casos. Sus zapatillas rojas también se han modificado para aprovechar los campos eléctricos y magnéticos para estimular los puntos de presión en el pie de Conan, lo que eleva su poder de patear. Al igual que sus tirantes, los cuales se pueden estirar alcanzando una longitud inimaginable y su reloj, que dispara dardos tranquilizantes a sus objetivos dejándolos dormidos y poder así, resolver los casos que se le van presentando.